Режиссер Тим Бертон ни минуты не сомневался, кто должен исполнить главную роль. Однако у продюсеров возникли некоторые опасения насчет "шоферской" походки бертоновского любимца, до сих пор гоняющего на сверхмощном мотоцикле. После нескольких репетиций и просмотра фильма "Глен или Гленда" актер усвоил легкую, чуть пританцовывающую походку Вуда. Вместе с походкой изменилась и актерская манера Джонни Деппа. Она стала раскованной и легкой. Больше всех был удивлен режиссер Тим Бертон: "Я никогда не видел Джонни таким непосредственным и открытым". Действительно, в этом фильме Джонни Депп воспользовался совершенно новым для себя арсеналом выразительных средств. Он показывает Эда Вуда этаким неисправимым оптимистом и отчасти параноиком, искренне верящим в собственную гениальность. Энтузиазм и оптимизм помогли Вуду преодолеть всеобщее презрение и оставить некоторый след во всемирной истории кино.
Не менее интересным оказалось выступление актера в криминальном жанре — фильм "Донни Браско" (1996). Агент ФБР, сумевший войти в доверие к боссу преступной организации (Аль Пачино), переживает тяжелую внутреннюю драму от необходимости предать тех, кто воспринимал его как надежного и верного друга. По мере того как приближается час закланья, в душе Донни крепнет смятение и ужас перед неизбежностью этого предательства. Донни перестает общаться с семьей, не выходит на связь с полицией. Но, в конечном итоге, долг полицейского берет верх над простыми человеческими чувствами. Представленная им информация привела к аресту 200 человек и гибели босса. Налет мрачной меланхолии, окружающей героя, придал особый колорит фигуре Донни Браско и всему фильму.
Определенным поворотом в творческой биографии Джонни Деппа стал фильм "Точно в срок" (1995), в котором он весьма энергично и азартно исполнил роль террориста поневоле, взявшего в руки пистолет исключительно из необходимости спасти жизнь собственного ребенка. Очки в тонкой золотой оправе, коротко подстриженные волосы, элегантный костюм с галстуком полностью изменили облик Джонни Деппа. Но самое главное, благодаря образу Джина Уотсона Джонни Депп наглядно продемонстрировал, что может трать самые разные роли, а не только те, где необходима мрачноватая самоуглубленность и откровенная враждебность к окружающему миру. И это самая приятная новость о кумире американских подростков, превратившемся в интересного и разностороннего актера. Джонни Депп в 1997 г. дебютировал в кино как режисссер фильмом "Храбрец". И хотя он не пользовался успехом, Депп намерен продолжать режиссерскую карьеру
24 мая 1999 Джонни стал отцом дочери Лили-Роз Мелоди, а 9 Апреля 2002 сына Джека Джона Кристофера Деппа Третьего. Своих детей он, безусловно, делит с их матерью - Ванессой Паради. Теперь, они так и живут, кочуя между Францией и Лос-Анжелесом.
Серьезно намереваясь стать рок музыкантом, Джонни Депп подписывал контракты с некоторыми группами, включая The Flame (которые позже стали называться The Kids или The Rock City Angels), и один раз он даже своим выступлением открывал концертный тур Иджи Попа. Следуя своим грандиозным планам, Депп вместе с первой женой и командой The Kids полетел в Лос-Анджелес, где ему пришлось заниматься продажей шариковых ручек по телефону. Однажды жена Элиссон представила его актеру Николасу Кейджу, который предложил Деппу заняться актерской карьерой и позже устроил для него встречу с агентом.
С его помощью Депп дебютировал в триллере Веса Кравена "Кошмар на улице Вязов" (1984), затем сыграл свою первую главную роль в "Private Resort" и засветился в эпизоде "Lady Blue" в 1985. После появления в телевизионном фильме "Медленное Горение" и "Взводе" для больших экранов, Депп, встав на замену Джеффа Йагера, выхватил удачный трехгодичный контракт на роль секретного полицейского Томми Хэнсона (1987-1990) в молодежном популярном сериале "21 Jump Street" компании Фокс. Эта роль сделала его кумиром молодежи и поместила на обложки некоторых журналов для подростков.